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新生儿感染后，弓形体经血行扩散可侵犯多个器官和组织，宿主细胞内寄生和繁殖，使细胞破坏，子孢子逸出后又侵犯邻近细胞，如此反复破坏，产生坏死灶，引起组织强烈炎性反应。当宿主产生免疫力，虫体繁殖受抑制形成不活动的组织包囊，而成为慢性感染。一旦宿主免疫力降低，即可从包囊内逸出，形成复发。弓形体亦可作为抗原引起过敏反应。此外尚可引起严重的继发性病变如梗死、钙化和发育障碍。
    
    病理
    
    中枢神经系统是先天性弓形体感染最常受损的部位。脑组织大片坏死，皮质变薄，脑内形成大小不等的囊腔，囊腔周围钙盐沉着。脑室阻塞出现脑积水、脑室扩大。脑内大小不等肉芽肿病变，以大脑皮质为主，亦可侵犯小脑、脑干和脊髓。眼球受累发生小眼、白内障、青光眼和脉络膜视网膜炎。肺部可有间质性炎症，心肌为增生性病变。肝、脾、肾上腺可有局部性坏死。